Software To Predict Exactly What Happens When You Edit A Gene

Sftware om te voorspellen wat er precies gebeurt wanneer u bewerken Een Gene

Zeven door de verwarde genetische web van precisie geneeskunde

Door Alexandra Ossola Geplaatst 23 juli 2015

Het genoom-editing enzym bekend als CAS9 aan het werk op een DNA-streng.

.

Genetica onderzoekers zijn erg enthousiast over CRISPR / Cas9, een enzym dat het gemakkelijker dan ooit voor wetenschappers om een ​​bepaald DNA-streng doelwit heeft gemaakt, knip een deel van het uit, en te vervangen. En hoewel het gebruik ervan in de mens is nog in de kinderschoenen, veel experts voorspellen dat engineering van het menselijk genoom is onvermijdelijk.

Tests op menselijke genen zijn duur en controversieel, en niemand is helemaal zeker of genveranderingen hun gewenste effect zal hebben. Nu de Canadese startup Deep Genomics beweert dat is een computerprogramma dat de verschillende mogelijke effecten van genetische manipulatie op basis van computers 'diep leren kan spelen uit ontwikkeld.

Begrijpen hoe genen werken is ingewikkeld, omdat ze bestaan ​​in een dialoog met andere genen, het draaien van elkaar of uit en het genereren van verschillende moleculen voor het lichaam te gebruiken. Onderzoekers hebben geprobeerd om deze relaties te begrijpen om beter te behandelen aandoeningen van kanker tot schizofrenie, maar het web lijkt te ingewikkeld voor ons om te begrijpen. Dat is waar diep leren komt in het gebruik van een enorme dataset van de mensen de genetische informatie met verschillende mutaties, kan Deep Genomics 'software leren hoe cellen lezen hun genetische code en welke moleculen ze maken als gevolg.

Deze informatie zou even nuttig voor nauwkeurig geneesmiddel behandelingen als voor genetische bewerking: "We kunnen ons systeem om de effectiviteit van therapie te bepalen, of het een geneesmiddel of een CRISPR / Cas-9 gen-editing systeem, wat is, onze technologie stelt ons in staat om de gevolgen van deze wijzigingen te voorspellen, "Deep Genomics oprichter Brendan Frey zei Moederbord." Dat is een heel moeilijk computationeel te doen; meeste experimentele benaderingen. "

Deep Genomics, die net lanceerde deze week, is niet het enige bedrijf met behulp van big data in de commerciële genetica rijk - 23andMe is ook de ontwikkeling van voorspellende software. Deep programma Genomics 'kijkt alleen naar mutaties die het proces van splicing, waarin nieuwe genen in DNA, dat niet de enige vorm van mutatie ingevoegd beïnvloeden.

Tot nu toe, als het moederbord verhaal notities, het maakt niet uit als het werk uitgevoerd door Deep Genomics 'stichters vóór de lancering is beter dan haar concurrenten. Maar wetenschappers beter kunnen ontcijferen genen voor behandelingen en het gebruik van CRISPR minder controversieel, genetische software of Deep Genomics algoritme of anderen, zullen ongetwijfeld van belang nauwkeurig de geneeskunde en verder worden

.
.
.